Az elektromágneses mezők, amelyeket a BEMER terápia nem képesek a pacemakereket vagy defibrillátorokat zavarni, ha ezek az eszközök megfelelnek az európai szabványoknak, és a vonatkozó működési feltételek szerint használják őket.
Az aktív orvosi implantátumok, amelyek stimulációt okoznak (pl. pacemakerek, defibrillátorok, agyi stimulátorok, izomstimulátorok) relatív ellenjavallatnak minősülnek. A BEMER terápia kiegészítő alkalmazását meg kell beszélni a kezelőorvossal.