Die bei der BEMER-Therapie verwendeten elektromagnetischen Felder sind nicht in der Lage, Herzschrittmacher oder Defibrillatoren zu stören, wenn diese Geräte den europäischen Normen entsprechen und gemäß den jeweiligen Betriebsbedingungen verwendet werden.
Aktive medizinische Implantate, die eine Stimulation verursachen (z. B. Herzschrittmacher, Defibrillatoren, Hirnstimulatoren, Muskelstimulatoren), gelten als relative Kontraindikation. Die ergänzende Anwendung der BEMER-Therapie muss mit dem behandelnden Arzt besprochen werden.