Aplikacja BEMER wspiera procesy samoregulacji i samoleczenia organizmu. Jest to możliwe tylko wtedy, gdy wszystkie inne substancje niezbędne dla ludzkiego organizmu (składniki odżywcze, witaminy, minerały, pierwiastki śladowe itp.) są obecne w wystarczających ilościach. Jeśli takie substancje są niewystarczające, mogą wystąpić objawy niedoboru (np. niedobór magnezu może powodować skurcze łydek, niedobór wapnia może prowadzić do skurczów ramion lub zaburzeń rytmu serca). Takich niedoborów nie można oczywiście uzupełnić za pomocą fizykoterapii naczyniowej.
Jeśli organizm jest obciążony toksynami (metale ciężkie, kwasy itp.), mogą wystąpić reakcje wydalania. Dlatego eliminacja takich substancji powinna być zawsze wspomagana innymi środkami, takimi jak picie dużej ilości wody o niskiej zawartości dwutlenku węgla.
Poprawiając przewodnictwo nerwowe, w niektórych przypadkach możliwe jest, że ból jest subiektywnie postrzegany jako bardziej intensywny. Nie jest to powód do przerwania terapii, ale raczej dowód na jej pozytywny efekt. W przypadku poważnych dolegliwości należy skonsultować się z lekarzem - najlepiej we współpracy z lekarzem prowadzącym - który jest zaznajomiony z fizykalną terapią naczyniową lub zasięgnąć porady medycznej przed rozpoczęciem terapii.