Aplikace BEMER podporuje samoregulační a samoléčebné procesy organismu. To je možné pouze tehdy, pokud jsou v dostatečném množství přítomny všechny ostatní látky nezbytné pro lidský organismus (živiny, vitaminy, minerály, stopové prvky atd.). Pokud je těchto látek nedostatek, mohou se objevit příznaky nedostatku (např. nedostatek hořčíku může způsobit křeče v lýtkách, nedostatek vápníku může vést ke křečím v pažích nebo poruchám srdečního rytmu). Takové nedostatky samozřejmě nelze odstranit pomocí fyzikální cévní terapie.
Pokud je tělo zatíženo toxiny (těžké kovy, kyseliny atd.), může dojít k vylučovací reakci. Proto by mělo být vylučování těchto látek vždy podpořeno dalšími opatřeními, jako je pití velkého množství málo sycené vody.
Zlepšením nervového vedení je v některých případech možné, že bolest je subjektivně vnímána jako intenzivnější. To není důvodem k přerušení léčby, ale spíše důkazem pozitivního účinku. V případě závažného stavu byste se měli před zahájením terapie poradit se zdravotníkem - nejlépe ve spolupráci s ošetřujícím lékařem -, který je obeznámen s fyzikální cévní terapií, nebo požádat o radu lékaře.